A Faculdade de Economia da Universidade Eduardo Mondlane existe deste 1971 e funcionava no 3º Andar do edifício da antiga Reitoria da UEM (na praça 25 de Junho, Baixa da Cidade de Maputo). Desde a sua fundação até 1986 ministrava somente o curso de  economia. Em 1986 introduziu também o Curso de Gestão. Até o ano 2000, já tinha graduado mais de 625 estudantes nos Cursos de Licenciatura e Bacharelato em Economia e Gestão. Como forma de responder a demanda cada vez mais crescente nos cursos leccionados nesta Escola, em 2001 introduziu o turno de Pós Laboral. Em 2004, introduziu o Curso de Licenciatura em Contabilidade e Finanças. Em 2006, os Cursos de Mestrado em Economia do Desenvolvimento e  de Gestão Empresarial. Actualmente, a Faculdade de Economia lecciona quatro cursos de Licenciatura, cinco cursos de mestrado e dois de Doutoramento.